本方法适用于总长度(载体+所有片段)不超过20kb的重组实验。在进行目的片段引物设计与PCR扩增时,建议使用高保真酶,以确保扩增的准确性。同时,要摸索退火温度,并优化反应体系和程序,以获得最佳结果。
载体线性化
双酶切:同时选择两种限制性内切酶对载体质粒进行线性化处理。内切酶的选择可参考相关文献及指南。
目的片段和线性化载体的纯化:推荐使用切胶回收的方法进行纯化,切胶时间控制在3分钟内,以避免紫外线对DNA的损害。使用NanoDrop或OneDrop等仪器检测回收浓度,浓度应≥20ng/μl,并通过跑胶验证是否为单一目的条带。
对于低浓度的回收产物,可通过增加PCR或酶切反应体系的方式,提高回收产物的浓度,采用多管反应,单管回收的方法。
目的片段与线性化载体连接重组
连接反应体系:根据说明书要求计算各组分的投入量,确保每个组分的体积≥1μl。如浓度过高,可进行稀释使用。
感受态转化涂板
选择DH5α、Fast-T1等克隆用的化学感受态细胞进行转化。感受态细胞不应反复冻融,建议在-80°C取出后一次性使用。重组产物与感受态细胞的体积比例为1:10,推荐10μl重组产物加入到100μl感受态细胞中。
热激时间应遵循感受态细胞的说明书进行设置。使用的平板需与转化载体的抗性一致。
在涂板时,将菌液进行离心(2500×g,3min),移除多余的LB培养基,保留100μl重悬后完成涂板。
单克隆菌落PCR鉴定
挑取平板中大小适中的单克隆菌落,避免选择过大或过小的菌落进行鉴定分析。将挑取的菌落放入含10μl ddH2O的15ml或2ml EP管中,混匀后吸取1-2μl作为PCR反应的模板。
推荐使用一对分别位于片段和载体的上下游引物进行PCR鉴定,以确保结果的准确性。
常见问题分析
1. 引物同源臂设计错误:应确保设计的长度(不计算酶切位点)在15-20bp之间,GC含量应在40-60%之间,以提高重组效率。
2. 重组反应体系不符合要求:片段和线性化载体总长度不得超过20kb,确保切胶回收后的浓度不低于20ng/μl。
3. 连接反应不适当:反应应在PCR仪中进行,并根据说明书设置温度和时间。
4. 阳性对照反应:使用试剂盒中的线性化载体和插入片段,按说明书配制重组反应体系,以排除其他实验材料及操作因素的影响。
5. 转化涂板操作不当:感受态细胞应选用DH5α、Fast-T1等,重组产物与感受态体积的比例为1:10,热激时间按照说明书进行操作,确保涂板前菌液的离心处理。
借助尊龙凯时的先进技术和高质量产品,可以更好地实现您的生物医学研究目标。确保遵循上述步骤和建议,以提高实验的成功率和结果的可靠性。